六扇门指的是衙门。
古代衙门为显示威严、气派，多开六扇门。后遂以六扇门代指官府、衙门。
六扇门被用为衙门代称的原因如下所述：
衙门以门为名，在这个建筑群里，各式各样的门户当然就具有头等重要的意义。不过最重要的是中轴线上的大门、仪门、宅门。
一、六扇门的由来。
整个衙门外墙唯一的出入口就是位于中轴线正南方位的大门。这个大门也叫“头门”，它并不是一个简单的门洞，而是一座有屋顶的建筑物。这种屋宇式大门是中国建筑的一大特点，它的形制受到法律、礼制的严格限制，无论多大的州县，大门都只能是三开间（建筑物正面的开间，两根柱子之间的横向空间为一间）。每间各安两扇黑漆门扇，总共有六扇门，所以州县衙门也往往俗称“六扇门”。俗谚“衙门六扇开，有理无钱莫进来”，俗称衙门的差役、书吏之类的工作人员为“六扇门里的勾当”
为了突出大门的重要性，大门前面有照壁，两侧有“八字墙”，门口有的还放置一对呲牙咧嘴的石头狮子。也有的州县把门屋升高为两层或三层的门楼，兼为全城报时的鼓楼或谯楼。谯字原义同瞧字，有瞭望的意思。
二、东进西出的规矩。
进了大门，沿着中轴线上砖铺的甬道，绕过屏墙，就到了第二道大门“仪门”。仪门内是集中政务功能的大堂院落，所以仪门也是重要的门户。据说仪门原来写作“謻”门，謻门原皇帝宫廷里的侧门，明朝时以官府衙署要比宫殿降等的缘故，因此用宫殿侧门的名称来称呼办公区域的正门。以后讹为“仪门”，又追加解释，认为是进入此门应该仪表堂堂，故称仪门。仪门也是三开间，一般进深仅一架。六扇门扇通常是紧闭的，只有在上官来到或州县官的长辈来临，才会打开，州县官在此迎送。
仪门平时关闭，要进出大堂院落就要走仪门两侧特开的便门。便门往往只是一个简单的门洞，也称“脚门”、“角门”。明代小说《醒世恒言》提到“大凡衙门，有个东进西出的规矩”，一般东便门进、西便门出，正和我们现在靠右行走的规则相同。
三、开后门从何来。
地方州县官的住所就在衙门中轴线的最北端，免费居住在此是他们的权利，但更是一项严格的义务。他们所住的宅院称之为“内衙”，或称“正衙”、“私衙”、“中衙”、“后宅”、“后衙”、“私宅”等等。内衙的出入口就是衙门建筑群中轴线最北端的“宅门”
宅门是整个衙门建筑群中戒备最为森严的门户之一。宅门总是终日上锁紧闭的，宅门的钥匙往往由州县官亲自保管。衙门里的衙役、书吏伺候官员只到宅门的门口为限，宅门内自有官员随身带来的私人仆役服侍，不到万不得已的情况，衙门的衙役书吏绝对不得进入内衙。
宅门也是屋宇式的大门，开间依旧限制在三开间以下。门屋内设门房，由官员的亲信长随把守。宅门东侧门扇上挖有望孔，门扇上设一个转桶，半个桶露门外、半个桶在门内。有客来访、或有信件、公文递到，把守大门的皂隶到宅门外打一下梆子，把来客的名片或公文、信件之类的东西放入转桶。宅门内的门房从望孔看清来人，转动转桶，把外面那一半转到里面来，取出东西呈送给官员。
衙门的内部院落门增减无所谓，可是大门之外在外墙上另开门洞就是不被允许的，尤其是不得在内衙的宅门外另开小门，直通衙门外面。考核时专门有此一项违法的项目，叫做“另开便门”。如清代的《六部成语批注．吏部》专有此条：“另开便门，外省官员在其衙署旁边另作小门，放其私人出入作弊。”可见另开小门是和作弊相连的，我们今天习称的“开后门”或许就是源自于此。